Différents conseils assurent la gouvernance de l'esä Dunkerque-Tourcoing :

- le Conseil d'Administration ;

- le Conseil de la Pédagogie et de la Vie Étudiante (CPVE) ;

- le Conseil scientifique ;

- le Conseil de Perfectionnement.

À ces quatre conseils, on peut ajouter :

- le Conseil de discipline ;

- le Règlement des études ;

- le Règlement des bibliothèques.